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2024-R0208 Ingénieur de recherche en bio-informatique (H/F) 34 - MONTPELLIER
Offre n° 173GQHM
2024-R0208 Ingénieur de recherche en bio-informatique (H/F)
34 - MONTPELLIER - Localiser avec Mappy
Actualisé le 05 mai 2024
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L'Université de Montpellier recrute en CDD un Ingénieur de recherche en bio-informatique (F/H). Au coeur du Campus du Cancer de Montpellier, l'IRCM avec tous ses partenaires stimule l'innovation en termes de recherche et d'enseignement dans la lutte contre le cancer. Notre équipe METECOL dirigée par le Dr. Jean-Emmanuel Sarry étudie les résistances thérapeutiques dans un cancer modèle (les Leucémies Aiguës Myéloïdes, LAM). Malgré l'efficacité des chimiothérapies et l'arrivée de thérapies ciblées, les rechutes restent fréquentes et le pronostic vital des patients atteints, faible. Nous avons mis en évidence que la résistance aux traitements des cellules LAM nécessite une adaptation de leur métabolisme. Ainsi notre projet est de caractériser la réponse métabolique et mitochondriale aux chimiothérapies conventionnelles et aux nouvelles thérapies ciblées en utilisant des modèles précliniques murins. Cette étude contribuera à élucider in vivo les mécanismes de résistance à la thérapie et fournira surtout des outils nécessaires pour tester de nouveaux agents thérapeutiques, pouvant cibler spécifiquement l'éradication des cellules résistantes. Ainsi, le projet de recherche de l'équipe est basé sur des modèles de type «patient-derived xenograft, PDX». Pour cela, l'équipe collabore étroitement avec des équipes de chercheurs et cliniciens de Toulouse et de Montpellier. Par ailleurs, nous caractérisons les populations de cellules résistantes par des approches multi-omiques et en cellules uniques. Mission principale : Analyser et intégrer des données multi-omiques en formats bulk et cellules uniques (priorité : RNAseq et proteomic/CyTOF, puis ATAC-seq, métabolomique, épitranscriptomique, etc.), exploiter les réseaux d'interactions moléculaires dans ce processus d'intégration, inférence de réseaux nouveaux, en particulier de réseaux intercellulaires. Participer à la définition de plans d'expériences avec les biologistes du projet. Echanger avec eux en cours d'analyse pour faciliter la compréhension des résultats et maximiser leur pertinence. Activités : Analyse et intégration de données via le développement de scripts R et/ou python ainsi que l'application d'outils existants. Intégration avec des données publiques existantes par ailleurs, organisation et structuration des données. Compétences / Qualifications : Données omiques et leur intégration, transcriptomique, protéomique, transcriptomique en cellules uniques, biologie des systèmes, machine learning, network science, algorithmes sur graphes. Programmation en R et éventuellement python, gestion de données et de workflows. Bioinformatique, communication, organisation, esprit d'équipe, savoir-être, implication et rigueur. La consultation du profil de poste et le dépôt des candidatures s'effectuent avant le 19/05/2024, sur le site de l'université : https://umemplois.umontpellier.fr/poste/2024-R0208 Seules les candidatures déposées sur l'application de l'Université de Montpellier seront prises en compte (aucun dépôt par mail ni sur un site de recrutement autre que celui de l'Université).
- Type de contrat
-
CDD - 12 Mois
Contrat travail - Durée du travail
- 35H Travail en journée
- Salaire
- Salaire brut : Mensuel de 2185 Euros à 2705 Euros sur 12 mois
- Déplacements
- Déplacements : Jamais
Profil souhaité
Expérience
- 3 An(s)Cette expérience est indispensable
Compétences
- Concevoir et gérer un projet
- Déterminer des protocoles d'expérimentation
- Mener des études et expérimentations à des fins d'innovation
- Planifier les étapes d'un projet
- Procéder à des tests, expérimentations
Informations complémentaires
- Qualification : Cadre
- Secteur d'activité : Enseignement supérieur
Entreprise
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Mme Gisèle ARNAL
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