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Ingénieur Bio-informaticien(ne) (H/F) 30 - NIMES
Offre n° 4548653
Ingénieur Bio-informaticien(ne) (H/F)
30 - NIMES - Localiser avec Mappy
Publié le 05 avril 2024
RESPONSABILITÉS : CDD d'un an Le laboratoire de Biochimie et Biologie Moléculaire du CHU de Nîmes comporte trois secteurs fonctionnels : la biochimie générale et spécialisée - hormonologie, la p harmacologie-Toxicologie générale et spécialisée ainsi que la génétique moléculaire. Laboratoire est labellisé Laboratoire de Biologie Médicale de Référence (LBMR) pour l'oncogénétique somatique, pour la génétique de la Sclérose Latérale Amyotrophique et pour la génétique des Troubles du Spectre Autistique. Il est accrédité ISO 15189. Certains biologistes participent aux interprétations des génomes sur la plateforme Auragen. Les activités principales du poste : 1 - Rôle principal : L'activité de l'ingénieur hospitalier bio-informaticien sera centrée sur le secteur de génétique moléculaire constitutionnelle, dans le cadre du diagnostic de la Sclérose Latérale Amyotrophique : - soutenir les biologistes dans leur démarche diagnostique, en recherchant et proposant des outils informatiques avancés pour l'analyse des données biologiques. - développer des pipelines d'analyse bio-informatique afin de traiter les données de séquençage d'exome et de RNA-Seq, fournir des analyses statistiques, mettre en place des outils d'aide à la visualisation des résultats, définir et suivre des indicateurs de performance - assurer la cohérence et la qualité des résultats - participer à la rédaction de protocoles et de procédures liés aux analyses bio-informatiques - participer à la démarche qualité du laboratoire et notamment aux contrôles de qualité EMQN pour l'activité NGS - participer à la gestion des bases de données 2 - Rôle transversal, au sein du plateau commun de biologie moléculaire L'ingénieur hospitalier bio-informaticien devra faire le lien entre la DSIH (Direction des Systèmes d'Information Hospitaliers) et le plateau commun de biologie moléculaire : - participer à la sauvegarde et à l'archivage des données informatiques - veiller à ce que les données de génétique soient stockées conformément aux normes de confidentialité - coordonner les projets bio-informatiques polaires - collaborer avec l'ensemble des laboratoires utilisateurs du plateau commun de biologie moléculaire pour assurer le bon fonctionnement des outils et des infrastructures nécessaires aux analyses bio-informatiques PROFIL RECHERCHÉ : Votre profil : - Vous détenez un diplôme de niveau BAC +5 dans un domaine scientifique - Vous détenez une formation en bio-informatique - Vous avez une première expérience en analyse de données NGS Idéalement, vous avez une expérience dans un autre laboratoire. Vos compétences : - Vous êtes capable d'interagir dans une environnement pluridisciplinaire : qualités relationnelles, d'écoute et de communication requises - Vous faites preuve d'une grande autonomie et êtes doté(e) d'une bonne capacité organisationnelle - Vous avez le sens du service - Vous êtes rigoureux(euse), faites preuve d'adaptabilité mais aussi de curiosité intellectuelle - Vous êtes dynamique et force de proposition
- Type de contrat
-
Contrat à durée déterminée - 12 Mois
Contrat travail - Durée du travail
- 35 H Travail en journée
Profil souhaité
Expérience
- Débutant accepté
Informations complémentaires
- Qualification : Cadre
Entreprise
CHU Nîmes
Le CHU de Nîmes, 1er employeur du Gard, s'inscrit dans une démarche de développement, soutenue par l'innovation médicale, médico-scientifique, architecturale, soignante et organisationnelle. Le CHU de Nîmes en 2024 représente 2000 lits, 7300 hommes et femmes qui œuvrent chaque jour (dont 1300 médecins) et 300 métiers différents. Rejoignez-nous et construisons ensemble l'Hôpital de demain !
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